RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421051.1

AP000289.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000289.1, Length 1,361 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000289.1-201ENST00000421051 CRISP2P16562 243 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 TFPI2P48307 235 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF83P51522 516 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 PIGYQ3MUY2 71 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 ACSM6Q6P461 480 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 LYG1Q8N1E2 194 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 OR4F5Q8NH21 305 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 DYRK2Q92630 601 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 CORO2AQ92828 525 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM186Q96B77 213 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 BORCS8Q96FH0 119 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SFRP2Q96HF1 295 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 DUX5Q96PT3 197 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 OR4F4Q96R69 305 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 A0A1B0GUS0 222 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 C3orf80F5H4A9 247 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 M0R1B8 84 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 TNFSF11O14788 317 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 CXCL13O43927 109 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 COX5AP20674 150 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 CD40P25942 277 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 RHOBP62745 196 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 GNB1P62873 340 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 MMDQ15546 238 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 CST9LP1Q5W188 147 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 OR10D3Q8NH80 312 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 BET1LQ9NYM9 111 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 IL36BQ9NZH7 164 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.87□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 A0A1W2PR80 420 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 DIRC3C9JPN6 131 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 C11orf94C9JXX5 98 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF253O75346 499 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 AVPP01185 164 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 IGKV1-39P01597 117 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 IGKV1D-39P04432 117 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 OR10J4P0C629 311 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 PRRX1P54821 245 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 LGALS4P56470 323 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 PMCHL1Q16048 86 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SPATA45Q537H7 98 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 FAM27BQ5VT28 67 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 Q6ZRM9 215 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 LINC00596Q86U02 117 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 GGNQ86UU5 652 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 CALHM1Q8IU99 346 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 OR2M3Q8NG83 312 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 C11orf52Q96A22 123 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.86□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 CD300LBA8K4G0 201 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 C9JCJ5 164 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 J3QR06 171 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 DHHO43323 396 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SYNGR3O43761 229 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 PAGE4O60829 102 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 IGKV1-5P01602 117 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SERPINE2P07093 398 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 P0C879 139 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 TNFSF4P23510 183 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 TSPOP30536 169 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 BATFQ16520 125 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 TCF24Q7RTU0 167 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 FADS6Q8N9I5 356 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SPSB4Q96A44 273 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 APH1AQ96BI3 265 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 KCNS1Q96KK3 526 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.85□□□□□ -1.15
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC25A22Q9H936 323 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms