RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35G3Q8N808 338 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52E5Q8NH55 327 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FANCD2OSQ96PS1 177 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5B12Q96R08 314 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HINT2Q9BX68 163 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0G2JRQ6 117 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNA17P01571 189 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-11P01762 117 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRH1P02810 166 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZP3P21754 424 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASAH1Q13510 395 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R1AQ13522 171 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C15orf32Q32M92 178 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF114Q8NC26 417 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CXorf58Q96LI9 332 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST8SIA3O43173 380 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2J3O76001 311 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 REG1AP05451 166 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPCS3P61009 180 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NMSQ5H8A3 153 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2C3Q8N628 320 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1P1Q8NH06 330 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR146Q96CH1 333 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUX3Q96PT4 197 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GU03 582 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCRBP04435 133 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A6P12236 298 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZRM9 215 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COQ8AQ8NI60 647 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP6V0BQ99437 205 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENY2Q9NPA8 101 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CACNG5Q9UF02 275 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087WW49 117 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf170A2RU37 121 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4E1P0C645 316 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMCO1Q147U7 214 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD55Q3KP44 614 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C4orf46Q504U0 113 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYG2Q86SG7 212 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFB8O95169 186 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNCAP37840 140 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNP2Q05952 138 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHRS2Q13268 280 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR13Q9NZ81 148 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CORTO00230 105 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OVOL1O14753 267 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WIPF1O43516 503 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLL1P15814 213 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INSL3P51460 131 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFA1P59665 94 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFA3P59666 94 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFA5Q01523 94 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TATDN3Q17R31 274 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUDT15Q9NV35 164 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HTR2BP41595 481 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFITM3Q01628 133 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENKURQ8TC29 256 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MITD1Q8WV92 249 aa11.76□□□□□ -0.53
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