RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0J9YY10 115 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1B0GX78 115 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 FUOMA2VDF0 154 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHGR1C9JFL3 82 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0QX08 132 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 FADS1O60427 444 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR5F1O95221 314 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 MARCKSL1P49006 195 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAA20P61599 178 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 STX5Q13190 355 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 MED21Q13503 144 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 COQ5Q5HYK3 327 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q6ZQT0 140 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 RASSF5Q8WWW0 418 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00526Q96FQ7 95 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC50A1Q9BRV3 221 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 C3orf18Q9UK00 162 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCCP43146 1447 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP24Q9UPU5 2620 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 C2orf70A6NJV1 201 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACOX3O15254 700 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV1-5P01602 117 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASAH2BP0C7U1 165 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRYGAP11844 174 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS12P25398 132 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 BRS3P32247 399 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLVS2Q5SYC1 327 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 AADACL3Q5VUY0 350 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 SFXN4Q6P4A7 337 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRN1Q6UXK5 716 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00311Q8N616 119 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR32P1Q8NGA4 272 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2T4Q8NH00 348 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 PFN4Q8NHR9 129 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIGXQ8TBF5 258 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLK6Q92876 244 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 DERL1Q9BUN8 251 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM96AQ9H5X1 160 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 CKLFQ9UBR5 152 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 EML5Q05BV3 1969 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 H0Y980 276 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0QZ92 97 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2T1O43869 369 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HTR1AP08908 422 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 UCHL3P15374 230 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPI1P17947 270 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYL12AP19105 171 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDE6HQ13956 83 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRK1Q15835 563 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEFB128Q7Z7B8 93 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM9CQ8IZT9 166 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf158Q8N1D5 194 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00471Q8N535 108 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q8N6K4 173 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4D11Q8NGI4 311 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB8BQ92930 207 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR51I1Q9H343 314 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 TP73-AS1Q9UF72 201 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLK9Q9UKQ9 250 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 EML6Q6ZMW3 1958 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 KMT2DO14686 5537 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR1I1O60431 355 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HYPMO75409 117 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 APOEP02649 317 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H2BOP23527 126 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H2BBP33778 126 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H2BDP58876 126 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H2BCP62807 126 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFITM2Q01629 132 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST2H2BEQ16778 126 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALKAL1Q6UXT8 129 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q6ZS49 121 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 SBSPONQ8IVN8 264 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 IQCF2Q8IXL9 164 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q8N814 137 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H2BHQ93079 126 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCGB3A1Q96QR1 104 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H2BNQ99877 126 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H2BMQ99879 126 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 EVC2Q86UK5 1308 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0R2N4 97 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB4BP61018 213 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB5BP61020 215 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMED1Q13445 227 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPANXN3Q5MJ09 141 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 GDF5OSQ5U4N7 250 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDPK2PQ6A1A2 396 aa0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.4 ms