RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317896.11

HFE-202, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HFE, Length 1,922 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-202ENST00000317896 WDR82Q6UXN9 313 aa11.52□□□□□ -0.56
HFE-202ENST00000317896 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.52□□□□□ -0.56
HFE-202ENST00000317896 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.52□□□□□ -0.56
HFE-202ENST00000317896 STPG3Q8N7X2 389 aa11.52□□□□□ -0.56
HFE-202ENST00000317896 OR4S2Q8NH73 311 aa11.52□□□□□ -0.56
HFE-202ENST00000317896 OSTCQ9NRP0 149 aa11.52□□□□□ -0.56
HFE-202ENST00000317896 CD46P15529 392 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 NPY1RP25929 384 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 Q6ZS92 163 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 RFESDQ8TAC1 157 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 SSMEM1Q8WWF3 244 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 KCNS1Q96KK3 526 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 TMEM140Q9NV12 185 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 IL19Q9UHD0 177 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 V9GYV3 84 aa11.52□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 HCFC1P51610 2035 aa11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 DIRC3C9JPN6 131 aa11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 CDKN1AP38936 164 aa11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 RAB7AP51149 207 aa11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 TIGITQ495A1 244 aa11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 KRTCAP3Q53RY4 240 aa11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 HELTA6NFD8 242 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 C15orf61A6NNL5 157 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 HLA-DQA1P01909 254 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 AMY1AP04745 511 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 REG1AP05451 166 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 GPX1P07203 203 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 IGHV1-2P23083 117 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 KRTDAPP60985 99 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 EDDM3AQ14507 147 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 LTC4SQ16873 150 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 MORN2Q502X0 79 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 Q6ZR03 302 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 MDS2Q8NDY4 140 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 OR4P4Q8NGL7 312 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 SLC35E1Q96K37 410 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 TAS2R45P59539 299 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 CX3CL1P78423 397 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 CENPWQ5EE01 88 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 A6NNC1 897 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 ITGB1BP1O14713 200 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 MGST3O14880 152 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 ZNF253O75346 499 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 PRDX2P32119 198 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 BATFQ16520 125 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 LRRC29Q8WV35 223 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 DEFB127Q9H1M4 99 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 GNB4Q9HAV0 340 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 METRNQ9UJH8 293 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 USF3Q68DE3 2245 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 NOTCH2Q04721 2471 aa11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 AMTP48728 403 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 LINC00205P59089 165 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 PRR20EP86478 221 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 PRR20CP86479 221 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 PRR20DP86480 221 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 PRR20BP86481 221 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 PRR20AP86496 221 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 SPATA45Q537H7 98 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 Q8TCH9 128 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 NRN1Q9NPD7 142 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 A1L4Q6 167 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 F2RL2O00254 374 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 ISLRO14498 428 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 LYZL6O75951 148 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 CGAP01215 116 aa11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HFE-202ENST00000317896 ARG2P78540 354 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms