RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 SLC45A2Q9UMX9 530 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 BSNQ9UPA5 3926 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 WFDC8Q8IUA0 241 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 ZGRF1Q86YA3 2104 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 E7EUB6 86 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 OR7C2O60412 319 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 SCGB1D1O95968 90 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 CHRNB4P30926 498 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF503Q96F45 646 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 PLXNB1O43157 2135 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 DOLPP1Q86YN1 238 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 PRNDQ9UKY0 176 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 ITGB1BP1O14713 200 aa20.64■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 FCN3O75636 299 aa20.64■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 CCKARP32238 428 aa20.64■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 SLC35B1P78383 322 aa20.64■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 PRCDQ00LT1 54 aa20.64■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 OR2T6Q8NHC8 308 aa20.64■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
HOXB3-201ENST00000311626 TRAV5A0A0B4J249 113 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 IRF2P14316 349 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 FXYD3Q14802 87 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 MORN5Q5VZ52 161 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 A8MWP6 167 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 TM4SF5O14894 197 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 ERVFC1-1P60608 527 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 PQLC2Q6ZP29 291 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 ADTRPQ96IZ2 230 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 F2Z2F3 143 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 GCGP01275 180 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 RTL8BQ17RB0 113 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 KRTCAP3Q53RY4 240 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF600Q6ZNG1 722 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 UHRF2Q96PU4 802 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF292O60281 2723 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 A8MXE2 369 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 IER3P46695 156 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 CENPWQ5EE01 88 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 C10orf55Q5SWW7 151 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 TXNDC17Q9BRA2 123 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 TNFSF4P23510 183 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 Q6ZS92 163 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 IL36BQ9NZH7 164 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 NAV3Q8IVL0 2385 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 TCL1AP56279 114 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 OR1L6Q8NGR2 347 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 MISP3Q96FF7 219 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 ACACAQ13085 2346 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 MT-CO2P00403 227 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 OR8I2Q8N0Y5 310 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 HARBI1Q96MB7 349 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 FKBP11Q9NYL4 201 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 NHLRC2Q8NBF2 726 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 RAB9BQ9NP90 201 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 HELTA6NFD8 242 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 POU2AF1Q16633 256 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 hADV38S2A0JD32 116 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 GGTLC3B5MD39 225 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 GNG4P50150 75 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 MMD2Q8IY49 270 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 KLK10O43240 276 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 LYPD2Q6UXB3 125 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 C11orf52Q96A22 123 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 LINC00479Q96M42 142 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 MS4A10Q96PG2 267 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 FOSL1P15407 271 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 LINC00310P59036 64 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 CCL17Q92583 94 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 SFXN3Q9BWM7 321 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 V9GYV3 84 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXB3-201ENST00000311626 POLEQ07864 2286 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXB3-201ENST00000311626 DPRXA6NFQ7 191 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXB3-201ENST00000311626 FCN1O00602 326 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXB3-201ENST00000311626 PAX1P15863 534 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXB3-201ENST00000311626 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXB3-201ENST00000311626 DLX1P56177 255 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXB3-201ENST00000311626 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXB3-201ENST00000311626 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXB3-201ENST00000311626 LGALS4P56470 323 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.9 ms