RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
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CXCL3-201ENST00000296026 C15orf62A8K5M9 175 aa14.52□□□□□ -0.09
CXCL3-201ENST00000296026 LY6G6CO95867 125 aa14.52□□□□□ -0.09
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CXCL3-201ENST00000296026 RNF183Q96D59 192 aa14.52□□□□□ -0.09
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CXCL3-201ENST00000296026 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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CXCL3-201ENST00000296026 GPX8Q8TED1 209 aa14.5□□□□□ -0.09
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CXCL3-201ENST00000296026 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.49□□□□□ -0.09
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CXCL3-201ENST00000296026 IGKV1-39P01597 117 aa14.48□□□□□ -0.09
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CXCL3-201ENST00000296026 OR4A16Q8NH70 328 aa14.48□□□□□ -0.09
CXCL3-201ENST00000296026 OR10C1Q96KK4 312 aa14.48□□□□□ -0.09
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CXCL3-201ENST00000296026 PRCDQ00LT1 54 aa14.46□□□□□ -0.09
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CXCL3-201ENST00000296026 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CXCL3-201ENST00000296026 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.45□□□□□ -0.1
CXCL3-201ENST00000296026 A0A087WXM4 84 aa14.45□□□□□ -0.1
CXCL3-201ENST00000296026 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.45□□□□□ -0.1
CXCL3-201ENST00000296026 GNG7O60262 68 aa14.45□□□□□ -0.1
CXCL3-201ENST00000296026 APOA1P02647 267 aa14.45□□□□□ -0.1
CXCL3-201ENST00000296026 RCVRNP35243 200 aa14.45□□□□□ -0.1
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