RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283882.3

CFDP1-201, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFDP1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-201ENST00000283882 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 ATP5SQ99766 215 aa9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 HINT2Q9BX68 163 aa9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 ARV1Q9H2C2 271 aa9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 E7EUB6 86 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 FNDC10F2Z333 226 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 H3BUX3 64 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 FCN1O00602 326 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 CST7O76096 145 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 34.5
CFDP1-201ENST00000283882 IFITM2Q01629 132 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 WT1-ASQ06250 92 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 SCGB2A2Q13296 93 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 VWC2Q2TAL6 325 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 TEX261Q6UWH6 196 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 ST8SIA2Q92186 375 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 ARPC1AQ92747 370 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.92□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 PRSS46E5RG02 174 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 CNIH1O95406 144 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 IFNA7P01567 189 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 OPN1MWP04001 364 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 FOSL1P15407 271 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 SNCAP37840 140 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 IER3P46695 156 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 GNB1P62873 340 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 CX3CL1P78423 397 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 DLK1P80370 383 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 ARL16Q0P5N6 197 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 FXYD3Q14802 87 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 BAP18Q8IXM2 172 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 LILRB2Q8N423 598 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM86BQ8N661 226 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM68Q96MH6 324 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.91□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 BTBD17A6NE02 478 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 CORTO00230 105 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 OR13C7P0DN81 318 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 CLINT1Q14677 625 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 Q6YL49 198 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 OR1P1Q8NH06 330 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 GINS3Q9BRX5 216 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 WFDC1Q9HC57 220 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF580Q9UK33 172 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.9□□□□□ -0.82
CFDP1-201ENST00000283882 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 IFNA5P01569 189 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 IFNA4P05014 189 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 CRYGCP07315 174 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 CTRB1P17538 263 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 NDPQ00604 133 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 KLK9Q2XQG4 91 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 P2RX4Q99571 388 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 MPDU1O75352 247 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 IGHV4-59P01825 116 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 AMY1AP04745 511 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 AREGP15514 252 aa9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CFDP1-201ENST00000283882 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms