RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 IGKV1-16P04430 117 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 LOXL3P58215 753 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM183BQ1AE95 376 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 TIGITQ495A1 244 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 PRR7Q8TB68 274 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 MMP23AO75900 390 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 JPT1Q9UK76 154 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 C15orf61A6NNL5 157 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 CCL13Q99616 98 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 DCAF16Q9NXF7 216 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 CLCF1Q9UBD9 225 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 V9GYV3 84 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 DMXL1Q9Y485 3027 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 J3QW42 95 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 RANP62826 216 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 PPP1R35Q8TAP8 253 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 APELAP0DMC3 54 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 MMDQ15546 238 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 MORN5Q5VZ52 161 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 FAM216BQ8N7L0 139 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF586Q9NXT0 402 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 CD59P13987 128 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 PAFAH1B2P68402 229 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 FAM168AQ92567 244 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 MIEN1Q9BRT3 115 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 GGTLC3B5MD39 225 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 YPEL1O60688 119 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 TNFSF13O75888 250 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 LCN12Q6JVE5 192 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 OR2T6Q8NHC8 308 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 YPEL2Q96QA6 119 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 NRN1Q9NPD7 142 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRH-201ENST00000263434 SRRM5B3KS81 715 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 MAJINQ3KP22 176 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 FAM90A1Q86YD7 464 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 TXN2Q99757 166 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 LINC00869P0C866 280 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 PYYP10082 97 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 CAMPP49913 170 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 SPATA45Q537H7 98 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 IL19Q9UHD0 177 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 Q6ZVH6 145 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 TACC2O95359 2948 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 BRS3P32247 399 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 STARD4Q96DR4 205 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 SLC45A2Q9UMX9 530 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 PROCRQ9UNN8 238 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 H3BTX0 84 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 SELENOTP62341 195 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 C17orf58Q2M2W7 97 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 TRAT1Q6PIZ9 186 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 RPRMLQ8N4K4 120 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM68Q96MH6 324 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 SLC35D1Q9NTN3 355 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 ATMQ13315 3056 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 DYSFO75923 2080 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 GPX1P07203 203 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 CHRNB4P30926 498 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF503Q96F45 646 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 USF1P22415 310 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 C10orf55Q5SWW7 151 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 DMRTA1Q5VZB9 504 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 TEX43Q6ZNM6 134 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 OR52E5Q8NH55 327 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 TXNDC17Q9BRA2 123 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 KALRNO60229 2985 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 REG1AP05451 166 aa12.55□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 WT1P19544 449 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 Q6ZN92 141 aa12.55□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 CD24P25063 80 aa12.55□□□□□ -0.4
PTPRH-201ENST00000263434 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms