RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641281.1

CCDC196-208, Transcript of coiled-coil domain containing 196, human

Gene CCDC196, Length 1,018 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	PTX4	Q96A99	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	CHEK1	O14757	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	PDCD6	O75340	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	PPP3R1	P63098	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	TPBG	Q13641	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	IRF3	Q14653	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	CDK10	Q15131	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	BANF2	Q9H503	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281		Q9H8V8	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC196-208	ENST00000641281	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CRYZL1	O95825	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OXT	P01178	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CD5	P06127	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CD2	P06729	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	AREG	P15514	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	MGMT	P16455	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	BDKRB2	P30411	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	PSMD7	P51665	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	HAMP	P81172	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	BAK1	Q16611	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	THYN1	Q9P016	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	LRP2	P98164	4655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	GNB3	P16520	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	TMED1	Q13445	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OXA1L	Q15070	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CADM3	Q8N126	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281		Q9H3A6	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281		E7EUB6	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	EBAG9	O00559	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	YIF1A	O95070	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	NAPSA	O96009	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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