RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A1	P23297	94 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RCVRN	P35243	200 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	P2RY4	P51582	365 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNG7	P62955	275 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	H3F3A	P84243	136 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	AES	Q08117	197 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR4	Q16378	134 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	C4orf26	Q17RF5	130 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF876P	Q49A33	203 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMUB2	Q71RG4	321 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GLTP	Q9NZD2	209 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DKKL1	Q9UK85	242 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PROCR	Q9UNN8	238 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		3.73	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF878	C9JN71	531 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SOCS3	O14543	225 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RLN2	P04090	185 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	IL5	P05113	134 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	AKAIN1	P0CW23	69 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PTHLH	P12272	177 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF2F2	P13984	249 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	REG3A	Q06141	175 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST3H3	Q16695	136 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PTX4	Q96A99	478 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM206A	Q9NX38	181 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB22A	Q9UL26	194 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	FLNC	Q14315	2725 aa		3.72	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC13	O75165	2243 aa		3.71	□□□□□ -1.81
EFHC1-223	ENST00000636616	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CIB4	A0PJX0	185 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PINLYP	A6NC86	204 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS44	E7EML9	344 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RER1	O15258	196 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SNAPC5	O75971	98 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	KBTBD11	O94819	623 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFB6	O95139	128 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	APOC1	P02654	83 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TTR	P02766	147 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TYMS	P04818	313 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRA1	P14867	456 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CXCL3	P19876	107 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB3A	P20336	220 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	GDF1	P27539	372 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	VEGFC	P49767	419 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TDGF1P3	P51864	188 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB14	P61106	215 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616		Q5BKY6	102 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SEH1L	Q96EE3	360 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL9	Q9H1A3	318 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		3.71	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		3.71	□□□□□ -1.82

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