RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631029.1

UBA3-213, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, human

TSL 5 BASIC

Gene UBA3, Length 123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBA3-213	ENST00000631029	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	S1PR3	Q99500	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SPEG	Q15772	3267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029		A8MXE2	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	UPK2	O00526	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	FOXH1	O75593	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SERF1A	O75920	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	AGFG2	O95081	481 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	FSTL3	O95633	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	GPX1	P07203	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	CRISP2	P16562	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	IGFBP2	P18065	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	CBLN1	P23435	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	PPOX	P50336	477 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	UTF1	Q5T230	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	RNF2	Q99496	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TM4SF5	O14894	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	CEACAM4	O75871	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	OR2J3	O76001	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SP9	P0CG40	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	GLRX	P35754	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MYCNOS	P40205	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	PAX2	Q02962	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF90	Q03938	601 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	RAB31	Q13636	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	LRP11	Q86VZ4	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms