RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	HLA-DRB1	P01911	266 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGF2	P09038	288 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMB6	P28072	239 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPCS3	P61009	180 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDP	Q00604	133 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576		G3V3Q6	166 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576		K7EPK0	472 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	APELA	P0DMC3	54 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FXYD3	Q14802	87 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM86B	Q8N661	226 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR52E5	Q8NH55	327 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CGB1	A6NKQ9	187 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0YIZ8	118 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSSCA1	O60232	199 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAS1L	P35410	378 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZS46	218 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBKS	Q9H477	322 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC01548	A6NM66	108 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM77	I1YAP6	450 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	WRB	O00258	174 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYNGR2	O43760	224 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPR137B	O60478	399 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRCD	Q00LT1	54 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATR	Q13535	2644 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSGN1	A6NI15	193 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPAN9	O75954	239 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM50A	O95807	157 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	IAPP	P10997	89 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HILS1	P60008	231 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	DTD1	Q8TEA8	209 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARPC1A	Q92747	370 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF126	Q9BV68	326 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLDN34	H7C241	214 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEDD	O75618	318 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGL1	Q08830	312 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	MBD2	Q9UBB5	411 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPB11	Q9Y547	144 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX22	C9J3V5	150 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BP45	60 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNAB3	O43448	404 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	MED6	O75586	246 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	WT1-AS	Q06250	92 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PARP11	Q9NR21	331 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZFP57	Q9NU63	452 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP6V0E1	O15342	81 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RLN2	P04090	185 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PET100	P0DJ07	73 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	AREG	P15514	252 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HTR2B	P41595	481 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOXA1	Q86UR1	476 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	THAP6	Q8TBB0	222 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR13C7	P0DN81	318 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAX9	P55771	341 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	LFNG	Q8NES3	379 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB40C	Q96S21	281 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ENY2	Q9NPA8	101 aa		7.23	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHG2	P01859	326 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	REG1A	P05451	166 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		7.22	□□□□□ -1.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		7.22	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms