RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 KCNAB3O43448 404 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 RAMP3O60896 148 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PROP1O75360 226 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SCGB2A1O75556 95 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 KBTBD11O94819 623 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 S1PR2O95136 353 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 IFNA17P01571 189 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 C1QBP02746 253 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A4P12235 298 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 REG1BP48304 166 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 RNF125Q96EQ8 232 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM140Q9NV12 185 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CACNG5Q9UF02 275 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 U3KQ87 197 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CR1P17927 2039 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 TNCP24821 2201 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0D9SG52 128 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 C15orf61A6NNL5 157 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CORTO00230 105 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 RRHO14718 337 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 TAAR5O14804 337 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SYNGR2O43760 224 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PITX3O75364 302 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 OR2F2O95006 317 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 NDUFA3O95167 84 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CNIH1O95406 144 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 FSHBP01225 129 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1D-33P01593 117 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1-33P01594 117 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1-16P04430 117 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 P0C879 139 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 G6PCP35575 357 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SNCAP37840 140 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 HTR2BP41595 481 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 P2RY1P47900 373 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 B2MP61769 119 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 RAB11AP62491 216 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 HBG1P69891 147 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 HBG2P69892 147 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 TNFRSF9Q07011 255 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 BAXQ07812 192 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 KLRD1Q13241 179 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PSG5Q15238 335 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 MMDQ15546 238 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 OR4A47Q6IF82 309 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 C5orf24Q7Z6I8 188 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 STX12Q86Y82 276 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CFHR4Q92496 578 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 GPR146Q96CH1 333 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CYYR1Q96J86 154 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SMIM8Q96KF7 97 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SSX3Q99909 188 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.87□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 MTORP42345 2549 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CLDN34H7C241 214 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 K7EPK0 472 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SOX15O60248 233 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 DEDDO75618 318 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 ADAP1O75689 374 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 MPC2O95563 127 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1-5P01602 117 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 SRD5A1P18405 259 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CXCL3P19876 107 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CAMLGP49069 296 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 H2BFSP57053 126 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 S100A10P60903 97 aa5.86□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 OR2F1Q13607 317 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms