RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BP45 60 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 HINT2Q9BX68 163 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOD1P15172 320 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 FBLN7Q53RD9 439 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 STPG2Q8N412 459 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ERHP84090 104 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 NHLH2Q02577 135 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC51BQ86UW2 128 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8N9W7 124 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF16O43320 207 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CA2P00918 260 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 OPN1MWP04001 364 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 OPN1MW2P0DN77 364 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 OPN1MW3P0DN78 364 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 HBG1P69891 147 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 HBG2P69892 147 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF562Q6V9R5 426 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf82Q7Z2V1 217 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SLA2Q9H6Q3 261 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA10P01566 189 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DRB1P01911 266 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 HTR2BP41595 481 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB112Q30KQ8 113 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 RASL11BQ9BPW5 248 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A33Q9BSK2 321 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM13Q9H4Q3 707 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXL17Q9UF56 701 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 MOB4Q9Y3A3 225 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CGB1A6NKQ9 187 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BUX3 64 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB11AP62491 216 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 NAV3Q8IVL0 2385 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC24A4Q8NFF2 622 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4C12Q96R67 309 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 FCN1O00602 326 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL15P1P0C7V9 234 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf55Q5SWW7 151 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1S2Q8NGQ3 325 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5R1Q8NH85 324 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM160Q9NX00 188 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NDX4 124 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 C15orf62A8K5M9 175 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 E7EUB6 86 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 M0QZK8 103 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CST7O76096 145 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CNIH1O95406 144 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 GNB1P62873 340 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 BSXQ3C1V8 233 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SPNS3Q6ZMD2 512 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 JTBO76095 146 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 HNF1AP20823 631 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 NPY1RP25929 384 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SNCAP37840 140 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5C1Q8NGR4 320 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 NOTCH2Q04721 2471 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 AKAP9Q99996 3911 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8U8P0C7N1 319 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 UBA52P62987 128 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 FXYD3Q14802 87 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf83Q53S99 150 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf56Q8N8D9 126 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10P1Q8NGE3 313 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10W1Q8NGF6 305 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 STOML3Q8TAV4 291 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GW64 132 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PMS2P5A8MQ11 134 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 DFFBO76075 338 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 18.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF266Q14584 549 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1FQ16864 119 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 YAE1D1Q9NRH1 226 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CYTL1Q9NRR1 136 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-206ENST00000588815 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLC7A0M8Q6 106 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 IER3P46695 156 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC9AQ6UXN8 241 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6YL49 198 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM217Q8N7C4 229 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF114Q8NC26 417 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 BTBD17A6NE02 478 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 CX3CL1P78423 397 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 WT1-ASQ06250 92 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 UBAC2Q8NBM4 344 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 ARPC1AQ92747 370 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM3Q9BZL3 60 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-206ENST00000588815 TLN2Q9Y4G6 2542 aa24.63■■□□□ 1.53
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