RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 SSTR5P35346 364 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 GATA4P43694 442 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTDAPP60985 99 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PSG5Q15238 335 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA45Q537H7 98 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4A47Q6IF82 309 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF738Q8NE65 137 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC29Q8WV35 223 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LOXL4Q96JB6 756 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 C12orf49Q9H741 205 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 GNB4Q9HAV0 340 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ST20Q9HBF5 79 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CALYQ9NYX4 217 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF24Q9Y225 148 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 RTTNQ86VV8 2226 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ESPL1Q14674 2120 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 MED12Q93074 2177 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GW15 77 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR33A8MZF0 331 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 AHRRA9YTQ3 701 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 J3QR06 171 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 K7EN84 100 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CORTO00230 105 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 UPK2O00526 184 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 DLL1O00548 723 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR7C2O60412 319 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 HSBP1O75506 76 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TOMM40O96008 361 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CELA3AP09093 270 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CGB3P0DN86 165 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CGB7P0DN87 165 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IRF2P14316 349 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFSF4P23510 183 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CHRNB4P30926 498 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LOXL3P58215 753 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5I1Q13606 314 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 S100A7AQ86SG5 101 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF114Q8NC26 417 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM222BQ8WU58 562 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPRBP23467 1997 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PS18 150 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf172C9J069 976 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CA2P00918 260 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-13P01766 116 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-DRB1P01911 266 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 G0S2P27469 103 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00310P59036 64 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PAX2Q02962 417 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CD69Q07108 199 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TBR1Q16650 682 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZN92 141 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TCF23Q7RTU1 214 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TSKUQ8WUA8 353 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF492Q9P255 531 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 DKK4Q9UBT3 224 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IL17BQ9UHF5 180 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 MED12LQ86YW9 2145 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.34□□□□□ -1.39
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