RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585299.1

NFE2L1-223, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 4

Gene NFE2L1, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-223	ENST00000585299	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	PRND	Q9UKY0	176 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	NSG2	Q9Y328	171 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	IGKV1-39	P01597	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	IGKV1D-39	P04432	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	GP9	P14770	177 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	PI3	P19957	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	SEC22A	Q96IW7	307 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	COL7A1	Q02388	2944 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	PPP5D1	E7EU14	171 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	SERPINE2	P07093	398 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CSN3	P07498	182 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR13C7	P0DN81	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	PIGP	P57054	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	WT1-AS	Q06250	92 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	MEF2D	Q14814	521 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CCDC140	Q96MF4	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	PEMT	Q9UBM1	199 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299		S4R3C0	116 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	C15orf61	A6NNL5	157 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299		H0Y980	276 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	IGHV3-23	P01764	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	TNFSF8	P32971	234 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	PPP5C	P53041	499 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR5B3	Q8NH48	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	MCFD2	Q8NI22	146 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CXorf58	Q96LI9	332 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	SOST	Q9BQB4	213 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	HINT2	Q9BX68	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	THYN1	Q9P016	225 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	DBX1	A6NMT0	343 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CYB5B	O43169	146 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR2C1	O95371	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	AKAIN1	P0CW23	69 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	ARL3	P36405	182 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	TMEM56	Q96MV1	263 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	TP53RK	Q96S44	253 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	COPZ2	Q9P299	210 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	DISC1	C4P0D8	188 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	GPHB5	Q86YW7	130 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR4A16	Q8NH70	328 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		12.77	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	FABP12	A6NFH5	140 aa		12.77	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	CCDC160	A6NGH7	325 aa		12.77	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	LGALS9	O00182	355 aa		12.77	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	CLEC3B	P05452	202 aa		12.77	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		12.77	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		12.77	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		12.77	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	B3GALNT1	O75752	331 aa		12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	ATG12	O94817	140 aa		12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	IGKV1-5	P01602	117 aa		12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	MFAP2	P55001	183 aa		12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	SP6	Q3SY56	376 aa		12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	C2orf70	A6NJV1	201 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299		P0C879	139 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NFE2L1-223	ENST00000585299	UCP1	P25874	307 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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