RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35G3Q8N808 338 aa25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 COA4Q9NYJ1 87 aa25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0G2JRQ6 117 aa25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAPPC2P0DI81 140 aa25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAPPC2BP0DI82 140 aa25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2E2Q96LR5 201 aa25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 MS4A10Q96PG2 267 aa25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa25.79■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0B4J2A0 478 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPB5A8MRT5 1133 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF491Q8N8L2 437 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4F17Q8NGA8 305 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4F4Q96R69 305 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHPKQ9UHJ6 478 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0B4J293 547 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN15O95858 294 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4E1P0C645 316 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 AREGP15514 252 aa25.78■■□□□ 1.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TPPP2P59282 170 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR31Q5SQ13 230 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLC7A0M8Q6 106 aa25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT19A8MXV4 375 aa25.77■■□□□ 1.72
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TRGV3P03979 118 aa25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRTM2Q8N967 370 aa25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT15Q9NV35 164 aa25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 VWFP04275 2813 aa25.76■■□□□ 1.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf170A2RU37 121 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYGCP07315 174 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMB6P28072 239 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB25P57735 213 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD55Q3KP44 614 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 C18orf65Q6ZTR6 163 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 HINT2Q9BX68 163 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTRB1P17538 263 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFA1P59665 94 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFA3P59666 94 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS2Q13268 280 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTRB2Q6GPI1 263 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYZL2Q7Z4W2 148 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10W1Q8NGF6 305 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENKURQ8TC29 256 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV6A0A075B6T7 132 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf46Q504U0 113 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZRM9 215 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf3Q8WVX3 66 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR146Q96CH1 333 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHFRP00374 187 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 C8orf86Q6ZUL3 223 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYG2Q86SG7 212 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDCD10Q9BUL8 212 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRCDQ00LT1 54 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 WT1-ASQ06250 92 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 NMSQ5H8A3 153 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNG5Q9UF02 275 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST8SIA3O43173 380 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 REG1AP05451 166 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNB4Q9HAV0 340 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0G2JLM5 398 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRH1P02810 166 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR13C7P0DN81 318 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 MECP2P51608 486 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 AARDQ4LEZ3 155 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 H2AFB2P0C5Z0 115 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFA4P12838 97 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP18Q8NEJ0 188 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNA17P01571 189 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SULT1A3P0DMM9 295 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 SULT1A4P0DMN0 295 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 COQ8AQ8NI60 647 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 USMG5Q96IX5 58 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 RUNX1Q01196 453 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf35Q6ZS72 473 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRARPQ7Z6K4 114 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHA3Q9HB20 300 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMED3Q9Y3Q3 217 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM223BA6NKX1 122 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 I3L521 148 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOGP84095 191 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK9Q2XQG4 91 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 TREML4Q6UXN2 200 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM223AQ8IWN6 122 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 NECAP1Q8NC96 275 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52E5Q8NH55 327 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5B12Q96R08 314 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACFD1Q9UGQ2 172 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK9Q9UKQ9 250 aa25.68■■□□□ 1.7
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