RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561407.1

TMOD2-206, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-206ENST00000561407 S100PBPQ96BU1 408 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 PPCDCQ96CD2 204 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 TBL1YQ9BQ87 522 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 GINS4Q9BRT9 223 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 DOHHQ9BU89 302 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 DDA1Q9BW61 102 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 NUDT9Q9BW91 350 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 SLC17A9Q9BYT1 436 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 UBQLN4Q9NRR5 601 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 SLC22A13Q9Y226 551 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-206ENST00000561407 ATG2BQ96BY7 2078 aa2.59□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 OBSL1O75147 1896 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 LRP4O75096 1905 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 DENND4CQ5VZ89 1909 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 A0A1B0GW64 132 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 GGT3PA6NGU5 568 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 OR5H1A6NKK0 313 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 GABARAPH6UMI1 98 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 J3QRE1 110 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 TAAR5O14804 337 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 PHOX2AO14813 284 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 MMP23AO75900 390 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF682O95780 498 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 HLA-DQB2P05538 268 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 C8GP07360 202 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 OR5AC1P0C628 307 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 CRISP2P16562 243 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 CELP19835 753 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF136P52737 540 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 CAV3P56539 151 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 PFN3P60673 137 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 SELENOWP63302 87 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 CCL7P80098 99 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 CDK6Q00534 326 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 AESQ08117 197 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 MAPK14Q16539 360 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 KHDC3LQ587J8 217 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 NCMAPQ5T1S8 102 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 GLT8D1Q68CQ7 371 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 CYB5R2Q6BCY4 276 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 SFXN4Q6P4A7 337 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 SMARCD3Q6STE5 483 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 BAP18Q8IXM2 172 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 ABCA7Q8IZY2 2146 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 LINC00471Q8N535 108 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 ACBD7Q8N6N7 88 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 GATD1Q8NB37 220 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 SUMF2Q8NBJ7 301 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 OR4K5Q8NGD3 323 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 OR5W2Q8NH69 310 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 TERB2Q8NHR7 220 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 NEK7Q8TDX7 302 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 GHSRQ92847 366 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 CMBLQ96DG6 245 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 OR52E6Q96RD3 313 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 TRIB3Q96RU7 358 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 STACQ99469 402 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 SCRT1Q9BWW7 348 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 SUCNR1Q9BXA5 334 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 DPY30Q9C005 99 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 FXYD6Q9H0Q3 95 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 FBXL15Q9H469 300 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 ACER3Q9NUN7 267 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 DOK5Q9P104 306 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 RAB22AQ9UL26 194 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 V9GYS6 101 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 COL4A2P08572 1712 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 EML5Q05BV3 1969 aa2.58□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 ANKRD12Q6UB98 2062 aa2.57□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 A0A087WWC5 75 aa2.57□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 C7orf77A4D0Y5 90 aa2.57□□□□□ -2
TMOD2-206ENST00000561407 KLLNB2CW77 178 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms