RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 RUNX1Q01196 453 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 IL17DQ8TAD2 202 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 J3QT63 122 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 DANCRP0C864 163 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PRDX4Q13162 271 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 UBALD1Q8TB05 177 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 IGLC2P0DOY2 106 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 IGLC3P0DOY3 106 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 VDAC1P21796 283 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF714Q96N38 554 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 OTOSQ8NHW6 89 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 TEX37Q96LM6 180 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 HMGA2P52926 109 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZT83 130 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 BRK1Q8WUW1 75 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NRGNQ92686 78 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM230Q96A57 120 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA25Q9BR10 227 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 WDR31Q8NA23 367 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 U3KQE9 123 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 OR9G1Q8NH87 305 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NUP205Q92621 2012 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0U1RRA0 63 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF688P0C7X2 276 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 GNB1P62873 340 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM219Q86XT9 240 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PRX2 142 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FXYD1O00168 92 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 RND3P61587 244 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PRE2 83 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRB-210ENST00000551525 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NPFFO15130 113 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PSG6Q00889 435 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPM0 123 aa5.34□□□□□ -1.55
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