RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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PTPRB-208ENST00000550358 H2BFSP57053 126 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZS92 163 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GUT8 65 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 C17orf98A8MV24 154 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 RAMP1O60894 148 aa7.11□□□□□ -1.27
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