RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	FBN2	P35556	2912 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	PSPN	O60542	156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	HPRT1	P00492	218 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	SERPINE2	P07093	398 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TMPRSS2	O15393	492 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	GYPA	P02724	150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	GNB2	P62879	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	NECAP1	Q8NC96	275 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	CCL17	Q92583	94 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	YPEL1	O60688	119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	PSG2	P11465	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	CD177	Q8N6Q3	437 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	SOX15	O60248	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	LY6H	O94772	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	SELENOT	P62341	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	ARL16	Q0P5N6	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	IRF2	P14316	349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	IL3RA	P26951	378 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	POLQ	O75417	2590 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	LRRC30	A6NM36	301 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997		H3BP45	60 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	IFNL4	K9M1U5	179 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TNFSF12	O43508	249 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	PDE6D	O43924	150 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	GOSR1	O95249	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	COL8A1	P27658	744 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	BRS3	P32247	399 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	CDKN1A	P38936	164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TPPP2	P59282	170 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	AES	Q08117	197 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	UBALD1	Q8TB05	177 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	COX6B1	P14854	86 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	COL8A2	P25067	703 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	PRDX2	P32119	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	STUM	Q69YW2	141 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	MMP23A	O75900	390 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-208	ENST00000546997	GABRA2	P47869	451 aa		13.52	□□□□□ -0.24

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