RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 DEFA4P12838 97 aa16.73■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 SYNJ2BPP57105 145 aa16.73■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 RPEL1Q2QD12 228 aa16.73■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 OR1L8Q8NGR8 309 aa16.73■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 OR13C8Q8NGS7 320 aa16.73■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.73■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 PRNDQ9UKY0 176 aa16.73■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 OR51B2Q9Y5P1 312 aa16.73■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 DISC1C4P0D8 188 aa16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 SERPINE2P07093 398 aa16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 AKAIN1P0CW23 69 aa16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 OR4C16Q8NGL9 310 aa16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 MRGPRFQ96AM1 343 aa16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 HINT2Q9BX68 163 aa16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 S4R3C0 116 aa16.72■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 H0Y980 276 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 LY86O95711 162 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 FAM209BQ5JX69 171 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 OR9G4Q8NGQ1 327 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 TP53RKQ96S44 253 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 TSC22D3Q99576 134 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 COPZ2Q9P299 210 aa16.71■□□□□ 0.27
PUS1-211ENST00000544662 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 DBX1A6NMT0 343 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 C15orf61A6NNL5 157 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 PPP5D1E7EU14 171 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 IGHV3-23P01764 117 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 OR13C7P0DN81 318 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 SPNP16150 400 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 WT1-ASQ06250 92 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 TATDN3Q17R31 274 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 IL34Q6ZMJ4 242 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 TMEM14BQ9NUH8 114 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 FKBP11Q9NYL4 201 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 DMRT1Q9Y5R6 373 aa16.7■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 HAPLN4Q86UW8 402 aa16.69■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 GDPD1Q8N9F7 314 aa16.69■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 OR5B3Q8NH48 314 aa16.69■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa16.69■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 CCDC140Q96MF4 163 aa16.69■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 SORL1Q92673 2214 aa16.68■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 SP6Q3SY56 376 aa16.68■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 CLEC19AQ6UXS0 136 aa16.68■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 OR51S1Q8NGJ8 323 aa16.68■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 OR4A16Q8NH70 328 aa16.68■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 PRRT1Q99946 306 aa16.68■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 MFSD2BA6NFX1 497 aa16.67■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 IGLV1-51P01701 117 aa16.67■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 CSN3P07498 182 aa16.67■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 S100A5P33763 92 aa16.67■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 CXorf58Q96LI9 332 aa16.67■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 TMEM56Q96MV1 263 aa16.67■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 V9GYH0 126 aa16.67■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 GGCTO75223 188 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 IGKV1-5P01602 117 aa16.66■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 ARL3P36405 182 aa16.66■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.66■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 TRIM16LQ309B1 348 aa16.66■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 PYDC2Q56P42 97 aa16.66■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 THYN1Q9P016 225 aa16.66■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 GPR132Q9UNW8 380 aa16.66■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 CYB5BO43169 146 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 OR2C1O95371 312 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 GP9P14770 177 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 UCP1P25874 307 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 AKR1C2P52895 323 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 MFAP2P55001 183 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 SLC25A24Q6NUK1 477 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 B9D2Q9BPU9 175 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 C5orf66Q9H5L9 145 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 SLC2A8Q9NY64 477 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 PEMTQ9UBM1 199 aa16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
PUS1-211ENST00000544662 B3GALNT1O75752 331 aa16.64■□□□□ 0.25
PUS1-211ENST00000544662 ATG12O94817 140 aa16.64■□□□□ 0.25
PUS1-211ENST00000544662 P0C879 139 aa16.64■□□□□ 0.25
PUS1-211ENST00000544662 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
PUS1-211ENST00000544662 CCDC190Q86UF4 302 aa16.64■□□□□ 0.25
PUS1-211ENST00000544662 ZNF502Q8TBZ5 544 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms