RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	CATR1	Q13166	79 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF585B	Q52M93	769 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	MARC2	Q969Z3	335 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CTDSP2	O14595	271 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	FCER2	P06734	321 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	NQO2	P16083	231 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ELK1	P19419	428 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PLET1	Q6UQ28	207 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	THYN1	Q9P016	225 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	DIABLO	Q9NR28	239 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM140	Q9NV12	185 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0A6YYH2	397 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777		A6NJ64	397 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM127	O75204	238 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CYB5B	O43169	146 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TGOLN2	O43493	480 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	S1PR2	O95136	353 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RPA2	P15927	270 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CBX5	P45973	191 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TAS2R20	P59543	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	OR2T8	A6NH00	312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777		A6NHS1	94 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	APOA1	P02647	267 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SERPINE2	P07093	398 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FGF2	P09038	288 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	GNRHR	P30968	328 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	COMMD9	Q9P000	198 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	XRCC3	O43542	346 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	APOC4	P55056	127 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	HERV-K104	P61576	105 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	ERVK-16	P61578	105 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	PMS2P11	Q13670	270 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0J9YWU9	116 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	CXorf65	A6NEN9	183 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FAM25A	B3EWG3	89 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FAM25C	B3EWG5	89 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	FAM25G	B3EWG6	89 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TSPAN4	O14817	238 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	SPRY2	O43597	315 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MZT2A	Q6P582	158 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDX11-222	ENST00000542777	MCFD2	Q8NI22	146 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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