RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539232.1

LMO3-220, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-220ENST00000539232 ZNF383Q8NA42 475 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 NABP2Q9BQ15 211 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 AGMATQ9BSE5 352 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 Q9N2K0 584 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 A0A087WWC5 75 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 A0A0B4J2A0 478 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 MARCH11A6NNE9 402 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 TRDCB7Z8K6 153 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 CA11O75493 328 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 MBP02144 154 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 FCGR3AP08637 254 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 CT45A6P0DMU7 189 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 CT45A5P0DMU8 189 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 CT45A7P0DMV0 189 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PTHLHP12272 177 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 NQO2P16083 231 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 TBPP20226 339 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 FGF7P21781 194 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PSMB6P28072 239 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 SULT1A2P50226 295 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 RAB7AP51149 207 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 TAS2R31P59538 309 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PYY3Q5JQD4 70 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 IZUMO1Q8IYV9 350 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 LFNGQ8NES3 379 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 DUX3Q96PT4 197 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 CLCC1Q96S66 551 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PHB2Q99623 299 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 RAB22AQ9UL26 194 aa5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 FCN1O00602 326 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PPP1R2P9O14990 202 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 YPEL1O60688 119 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PRSS3P35030 304 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 GPR12P47775 334 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PCP4P48539 62 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 HLA-DRB3P79483 266 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 HTD2P86397 168 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 NDPQ00604 133 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 BTNL8Q6UX41 500 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 MITD1Q8WV92 249 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 GALMQ96C23 342 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 GALNT14Q96FL9 552 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 AQP10Q96PS8 301 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 YPEL2Q96QA6 119 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 S1PR3Q99500 378 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PRRT1Q99946 306 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 KLK11Q9UBX7 282 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 JPT1Q9UK76 154 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 HSF4Q9ULV5 492 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 GAB2Q9UQC2 676 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 HERC2O95714 4834 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa5.68□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 LCE6AA0A183 80 aa5.67□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.67□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.67□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 TMEM235A6NFC5 223 aa5.67□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 SERPINE3A8MV23 424 aa5.67□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 A8MWP6 167 aa5.67□□□□□ -1.5
LMO3-220ENST00000539232 G3V318 75 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms