RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ZNF695Q8IW36 515 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GAPTQ8N292 157 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF525Q8N782 197 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FAM210BQ96KR6 192 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PFDN5Q99471 154 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CACNA1CQ13936 2221 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ALPK2Q86TB3 2170 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF727A8MUV8 499 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM250H0YL14 139 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CBR3O75828 277 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IFNA1P01562 189 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IFNA5P01569 189 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OPN1LWP04000 364 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TYMSP04818 313 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 P0C879 139 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TRGC1P0CF51 173 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 B4GALT1P15291 398 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 F2RP25116 425 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 S100GP29377 79 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 APLNRP35414 380 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CD200P41217 278 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DEFA6Q01524 100 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF154Q13106 437 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PRDX4Q13162 271 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MSMO1Q15800 293 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF726P1Q15940 193 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CEACAM16Q2WEN9 425 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GUSBP11Q6P575 273 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CALHM1Q8IU99 346 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FRZBQ92765 325 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NAT6Q93015 286 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GPR146Q96CH1 333 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 C14orf144Q96I85 54 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CRLF2Q9HC73 371 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NAT8Q9UHE5 227 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 VAX2Q9UIW0 290 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RFNGQ9Y644 331 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GV50 99 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR5B21A6NL26 309 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 C9J4A7 227 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TSTD3H0UI37 97 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CYB5BO43169 146 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CHST1O43916 411 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CST7O76096 145 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1-39P01597 117 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1-5P01602 117 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TRGC2P03986 189 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1D-39P04432 117 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SCTP09683 121 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FGF7P21781 194 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OMGP23515 440 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DDTP30046 118 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NDUFA6P56556 154 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RAB4BP61018 213 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HBG1P69891 147 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HBG2P69892 147 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GAMTQ14353 236 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.22□□□□□ -1.89
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