RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PNKD	Q8N490	385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF2	Q99496	336 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PS18	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746		A8MXE2	369 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	C21orf140	B9A014	251 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746		M0R1X1	148 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FCN1	O00602	326 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FCGR3B	O75015	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXH1	O75593	365 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFB8	O95169	186 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MT-ND6	P03923	174 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	HNF1A	P20823	631 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PRDX2	P32119	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IER3	P46695	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GABRA2	P47869	451 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	COX19	Q49B96	90 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	VASH2	Q86V25	355 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NIT1	Q86X76	327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	PI4KA	P42356	2102 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	SPEG	Q15772	3267 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	BMPR1B	O00238	502 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	ISLR	O14498	428 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	MT-CO2	P00403	227 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CA2	P00918	260 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CGA	P01215	116 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	AMY1A	P04745	511 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5G3	P0C626	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	NPY1R	P25929	384 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-212	ENST00000515746	CFHR2	P36980	270 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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