RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
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ITGA3-211ENST00000508100 SSR3Q9UNL2 185 aa12.16□□□□□ -0.46
ITGA3-211ENST00000508100 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
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ITGA3-211ENST00000508100 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.15□□□□□ -0.46
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ITGA3-211ENST00000508100 TRAPPC2BP0DI82 140 aa12.15□□□□□ -0.46
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ITGA3-211ENST00000508100 OR51H1Q8NH63 302 aa12.15□□□□□ -0.46
ITGA3-211ENST00000508100 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.15□□□□□ -0.46
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ITGA3-211ENST00000508100 C20orf24Q9BUV8 137 aa12.15□□□□□ -0.46
ITGA3-211ENST00000508100 PLEKHA2Q9HB19 425 aa12.15□□□□□ -0.46
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ITGA3-211ENST00000508100 TMEM17Q86X19 198 aa12.14□□□□□ -0.47
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ITGA3-211ENST00000508100 RNF183Q96D59 192 aa12.14□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
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ITGA3-211ENST00000508100 NDUFA4O00483 81 aa12.13□□□□□ -0.47
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ITGA3-211ENST00000508100 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa12.12□□□□□ -0.47
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ITGA3-211ENST00000508100 GALNT14Q96FL9 552 aa12.12□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 ATP6V0BQ99437 205 aa12.12□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa12.11□□□□□ -0.47
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ITGA3-211ENST00000508100 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.11□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.11□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 OR5B3Q8NH48 314 aa12.11□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 SCARB1Q8WTV0 552 aa12.11□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
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ITGA3-211ENST00000508100 AUNIPQ9H7T9 357 aa12.11□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa12.1□□□□□ -0.47
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ITGA3-211ENST00000508100 GNRHRP30968 328 aa12.09□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.09□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa12.09□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 EHFQ9NZC4 300 aa12.09□□□□□ -0.47
ITGA3-211ENST00000508100 SMPXQ9UHP9 88 aa12.09□□□□□ -0.47
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