RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB14P61106 215 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HBG1P69891 147 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HBG2P69892 147 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 PRCDQ00LT1 54 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF266Q14584 549 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 PSG5Q15238 335 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SSX2Q16385 188 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CLLU1Q5K131 121 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP5SQ99766 215 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 REG4Q9BYZ8 158 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 C15orf62A8K5M9 175 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 MOSP00540 346 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV1-69P01742 117 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 MYOD1P15172 320 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SAA4P35542 130 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ARL16Q0P5N6 197 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 EBI3Q14213 229 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CLINT1Q14677 625 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP6V1FQ16864 119 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 MMD2Q8IY49 270 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 AJUBAQ96IF1 538 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 GINS3Q9BRX5 216 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ABCA1O95477 2261 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TNCP24821 2201 aa8.6□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PN81 502 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF223E7ERA6 249 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 J3QLI3 93 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HAX1O00165 279 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 RRHO14718 337 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 IFNA10P01566 189 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 IFNA5P01569 189 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV1D-33P01593 117 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV1-33P01594 117 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CNTFRP26992 372 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 BRS3P32247 399 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CHRNA7P36544 502 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 F2RL1P55085 397 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB11AP62491 216 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 PRSS8Q16651 343 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 NPBQ8NG41 125 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 C17orf50Q8WW18 174 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HINT2Q9BX68 163 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CR1P17927 2039 aa8.59□□□□□ -1.03
ECHDC3-204ENST00000495787 NBR2O15453 112 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CD5LO43866 347 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFA3O95167 84 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 OR8U8P0C7N1 319 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SEC11BP0C7V7 166 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 HES1Q14469 280 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 MMDQ15546 238 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 LILRB2Q8N423 598 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 Q8N6K4 173 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TMED6Q8WW62 240 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FBXL15Q9H469 300 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA1456Q9P272 454 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 ANK2Q01484 3957 aa8.58□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00862A6NCI5 91 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CGB1A6NKQ9 187 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 FBXO24O75426 580 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 ACTL6BO94805 426 aa8.57□□□□□ -1.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CA2P00918 260 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms