RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TTTY12Q9BZ98 90 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC3O15438 1527 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0C4DFX4 3053 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 UGGT1Q9NYU2 1555 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC88BA6NC98 1476 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 DCCP43146 1447 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 FMN1Q68DA7 1419 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 LST1O00453 97 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA16P05015 189 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 S100A6P06703 90 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 BPGMP07738 259 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA6P08185 405 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SULT1A1P50225 295 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 MYL6P60660 151 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 FAM201AQ5SY85 155 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf74Q6P047 294 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D19Q8N5T2 526 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 MAST1Q9Y2H9 1570 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G10O15496 165 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 S1PR2O95136 353 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 KCNE1P15382 129 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 CA5AP35218 305 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 Q8NDZ9 215 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SIPA1L1O43166 1804 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 LAMB4A4D0S4 1761 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 COL4A2P08572 1712 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TULP4Q9NRJ4 1543 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SCN9AQ15858 1988 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 H3BRN7 92 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 HAAOP46952 286 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 EMP1P54849 157 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35B4Q969S0 331 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC42Q96M95 316 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 ABCA6Q8N139 1617 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 PLXNA3P51805 1871 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC5O15440 1437 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 CROCC2H7BZ55 1655 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 A8MUN3 132 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB8P28062 276 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 RAB13P51153 203 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SPCS3P61009 180 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 PMAIP1Q13794 54 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SSX8Q7RTT4 187 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 CNBD2Q96M20 576 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 UCK1Q9HA47 277 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 COL6A3P12111 3177 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-212ENST00000491302 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0J9YW62 118 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 KLRC4O43908 158 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH3A1P30838 453 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 OMPP47874 163 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 GLT8D1Q68CQ7 371 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 LYZL1Q6UWQ5 148 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 OR52E6Q96RD3 313 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 BAHCC1Q9P281 2608 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ABCA3Q99758 1704 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 SZT2Q5T011 3432 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 CD79AP11912 226 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP12-3P60328 96 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 MROH1Q8NDA8 1641 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 USP32Q8NFA0 1604 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 IQGAP2Q13576 1575 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRB3O60242 1522 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JQZ4 141 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 SRP19P09132 144 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 CCR2P41597 374 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 CSN1S1P47710 185 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 OR4D2P58180 307 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZTI0 123 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.25□□□□□ -1.89
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