RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF253	O75346	499 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	RHBDL1	O75783	438 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR2J2	O76002	312 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	MT-CO2	P00403	227 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	COX5A	P20674	150 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	REG1B	P48304	166 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	DYNLT3	P51808	116 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	CLDN18	P56856	261 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	CCL20	P78556	96 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SRY	Q05066	204 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	KISS1	Q15726	138 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	PSG3	Q16557	428 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q6ZN92	141 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	PSMF1	Q92530	271 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	LHX4	Q969G2	390 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	AMELY	Q99218	206 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A087WZ39	114 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A0A6YYD4	124 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A1B0GV72	72 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A1W2PNV4	684 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	HELT	A6NFD8	242 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679		H0Y980	276 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SH2D1B	O14796	132 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	XRCC2	O43543	280 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SSSCA1	O60232	199 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZG16	O60844	167 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	NPIPB7	O75200	414 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	S1PR2	O95136	353 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	GYPA	P02724	150 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGKV3-11	P04433	115 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	CTLA4	P16410	223 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	KITLG	P21583	273 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	CD1B	P29016	333 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	IL12B	P29460	328 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR1D4	P47884	311 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	RHOB	P62745	196 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	P2RY6	Q15077	328 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	VAMP3	Q15836	100 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	BATF	Q16520	125 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	HLA-B	Q31612	363 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	NIT1	Q86X76	327 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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