RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478150.1

STX4-208, Transcript of syntaxin 4, human

TSL 4

Gene STX4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX4-208	ENST00000478150	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.89	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	DEFA4	P12838	97 aa		13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	MYOD1	P15172	320 aa		13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	DHODH	Q02127	395 aa		13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150		A0A0G2JLM5	398 aa		13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	LINC01619	G3V211	115 aa		13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	VAMP1	P23763	118 aa		13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.87	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TNC	P24821	2201 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150		K7EIL1	84 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	CYB5B	O43169	146 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	BRI3	O95415	125 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	REG1A	P05451	166 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	UCP1	P25874	307 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	DEFA5	Q01523	94 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	CCDC32	Q9BV29	185 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.86	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150		A0A087WW49	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	PRH1	P02810	166 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	CCR6	P51684	374 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	DCUN1D4	Q92564	292 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	OVOL1	O14753	267 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	AREG	P15514	252 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	INSL3	P51460	131 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	SLURP1	P55000	103 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	SRPX	P78539	464 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	CD69	Q07108	199 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
STX4-208	ENST00000478150	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	OR2J3	O76001	311 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	IFNA17	P01571	189 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	FGF2	P09038	288 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	PSMB6	P28072	239 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	RHOG	P84095	191 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.83	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150		E7EUB6	86 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	LYRM1	O43325	122 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	LGI3	Q8N145	548 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	PRR13	Q9NZ81	148 aa		13.82	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		13.81	□□□□□ -0.2
STX4-208	ENST00000478150	IGKV1-5	P01602	117 aa		13.81	□□□□□ -0.2

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