RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 GPR132Q9UNW8 380 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 A0A0G2JLM5 398 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SERPINE2P07093 398 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 OR9G9P0C7N8 305 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SYNJ2BPP57105 145 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SSX9Q7RTT3 188 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 TSC22D3Q99576 134 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SPIN2AQ99865 258 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 U3KQK5 164 aa9.94□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 MARCH11A6NNE9 402 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 BRI3O95415 125 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 LPAR6P43657 344 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 RHOGP84095 191 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 DHODHQ02127 395 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 Q8N1Y9 231 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.93□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 RYR3Q15413 4870 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 TEX22C9J3V5 150 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SNAPC5O75971 98 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 OR2J3O76001 311 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 S1PR2O95136 353 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 IGLV1-51P01701 117 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 ANXA3P12429 323 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 IL7P13232 177 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 EDN2P20800 178 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 ZP3P21754 424 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 ZNF846Q147U1 533 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 BAK1Q16611 211 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 ZNF585BQ52M93 769 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 OR4A47Q6IF82 309 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 S4R3C0 116 aa9.92□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 CGB1A6NKQ9 187 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 BMPR1BO00238 502 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 UPK2O00526 184 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 IGHV3-23P01764 117 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 CSN3P07498 182 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 AREGP15514 252 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 UCP1P25874 307 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SRPXP78539 464 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 ATP5G2Q06055 141 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 FAM219AQ8IW50 185 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 GALNT14Q96FL9 552 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 USMG5Q96IX5 58 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 NAA60Q9H7X0 242 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 TMEM140Q9NV12 185 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 PRNDQ9UKY0 176 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.91□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 PPP5D1E7EU14 171 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 NDUFB8O95169 186 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 REG1AP05451 166 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 HLA-GP17693 338 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 PI3P19957 117 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 RPEL1Q2QD12 228 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 TRIM16LQ309B1 348 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-211ENST00000478087 IL22RA2Q969J5 263 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms