RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-208ENST00000472230 TREML4Q6UXN2 200 aa14.76□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 MMD2Q8IY49 270 aa14.76□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 SVBPQ8N300 66 aa14.76□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.76□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.76□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.76□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14.75□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 A0A1B0GW64 132 aa14.75□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 A0A1W2PRF3 423 aa14.75□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 A0A1W2PRM7 423 aa14.75□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.75□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.75□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.75□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.75□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 FOXH1O75593 365 aa14.75□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.75□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 HCP5Q6MZN7 132 aa14.75□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 FAM168AQ92567 244 aa14.75□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 C9JQL5 133 aa14.74□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 TIMM23O14925 209 aa14.74□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 CNTFRP26992 372 aa14.74□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 LGALS4P56470 323 aa14.74□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.74□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 RAB31Q13636 194 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 ZNF726P1Q15940 193 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 TNXAQ16473 311 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 HAGHQ16775 308 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 SCRT1Q9BWW7 348 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 SIRPDQ9H106 197 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.73□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 FNDC10F2Z333 226 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 TOX4O94842 621 aa14.73□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 TEPPQ6URK8 271 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.73□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 E7EUB6 86 aa14.72□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 M6PRP20645 277 aa14.72□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 OPRK1P41145 380 aa14.72□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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GCFC2-208ENST00000472230 OR13C7P0DN81 318 aa14.71□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 GNB1P62873 340 aa14.71□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.71□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.71□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.71□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.71□□□□□ -0.05
GCFC2-208ENST00000472230 CGB1A6NKQ9 187 aa14.71□□□□□ -0.06
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