RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 SGMS2Q8NHU3 365 aa15.01□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa15.01□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 TSTD3H0UI37 97 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1-16P04430 117 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 CCL8P80075 99 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 PRCDQ00LT1 54 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 FOXL1Q12952 345 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM108Q6UXF1 575 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
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SYNE4-204ENST00000465425 LINC00574Q9H8X3 128 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 FNDC10F2Z333 226 aa15□□□□□ -0.01
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SYNE4-204ENST00000465425 CT45A6P0DMU7 189 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 CT45A5P0DMU8 189 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 CT45A7P0DMV0 189 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 TNFRSF1AP19438 455 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 HNF1AP20823 631 aa15□□□□□ -0.01
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SYNE4-204ENST00000465425 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
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SYNE4-204ENST00000465425 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 ACTL6BO94805 426 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
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SYNE4-204ENST00000465425 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 NUP37Q8NFH4 326 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 PLCE1Q9P212 2302 aa14.99□□□□□ -0.01
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SYNE4-204ENST00000465425 PRR20AP86496 221 aa14.99□□□□□ -0.01
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.99□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 K7EM74 188 aa14.98□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 OCC1Q8TAD7 63 aa14.98□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 CHODLQ9H9P2 273 aa14.98□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.98□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM18Q96B42 140 aa14.98□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
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SYNE4-204ENST00000465425 TEX38Q6PEX7 206 aa14.97□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 GZMBP10144 247 aa14.97□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.97□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 OR5B3Q8NH48 314 aa14.97□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 FAM122AQ96E09 287 aa14.97□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 BET1LQ9NYM9 111 aa14.97□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.97□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 APOA2P02652 100 aa14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 CCKARP32238 428 aa14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 PSG5Q15238 335 aa14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 PRSS8Q16651 343 aa14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 NABP2Q9BQ15 211 aa14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 PRO1933Q9H354 126 aa14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.96□□□□□ -0.01
SYNE4-204ENST00000465425 MGAQ8IWI9 3026 aa14.96□□□□□ -0.02
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SYNE4-204ENST00000465425 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 DYSFO75923 2080 aa14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 C16orf97H3BN30 126 aa14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 OR4A8P0C604 315 aa14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 LINC00869P0C866 280 aa14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 C2orf83Q53S99 150 aa14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 MOB3BQ86TA1 216 aa14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 C11orf52Q96A22 123 aa14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 HARBI1Q96MB7 349 aa14.95□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 C17orf100A8MU93 164 aa14.94□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 GCGP01275 180 aa14.94□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF90Q03938 601 aa14.94□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 SLC35E1Q96K37 410 aa14.94□□□□□ -0.02
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF714Q96N38 554 aa14.94□□□□□ -0.02
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