RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	CST11	Q9H112	138 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	HMG20A	Q9NP66	347 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	KIF25	Q9UIL4	384 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936		R4GMQ9	66 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	KMT2A	Q03164	3969 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936		M0QXV9	152 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	DYNC1I1	O14576	645 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	SC5D	O75845	299 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	IGLV2-11	P01706	119 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	HLA-DRB1	P01911	266 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	CGB3	P0DN86	165 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	CGB7	P0DN87	165 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	CCL1	P22362	96 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	HTR1F	P30939	366 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	SSTR5	P35346	364 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	RANBP1	P43487	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	ALDH3B2	P48448	385 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	SYNJ2BP	P57105	145 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	RAB40B	Q12829	278 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	GUCA2B	Q16661	112 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	COX19	Q49B96	90 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	C22orf42	Q6IC83	251 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	ZFP82	Q8N141	532 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	DEFB125	Q8N687	156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	OR52E5	Q8NH55	327 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	PP6455	Q8WZ26	134 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	ISOC2	Q96AB3	205 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	APOL4	Q9BPW4	351 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	NABP2	Q9BQ15	211 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	REEP1	Q9H902	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	RHOF	Q9HBH0	211 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	BATF3	Q9NR55	127 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936		A0A0J9YWU9	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	OR11H12	B2RN74	326 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	GOSR2	O14653	212 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM50A	O95807	157 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TRGV3	P03979	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	GNAO1	P09471	354 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	ANXA3	P12429	323 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	GZMH	P20718	246 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	AADAC	P22760	399 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	P2RY1	P47900	373 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	MED21	Q13503	144 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	GINS1	Q14691	196 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	RPEL1	Q2QD12	228 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936		Q6P435	159 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	SMIM29	Q86T20	159 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	SLC51B	Q86UW2	128 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM17	Q86X19	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CEP170-209	ENST00000464936	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.35	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms