RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 ST8SIA3O43173 380 aa8.04□□□□□ -1.12
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GARNL3-211ENST00000460176 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 CFHR3Q02985 330 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 SMCO1Q147U7 214 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 AWAT1Q58HT5 328 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF429Q86V71 674 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.04□□□□□ -1.12
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GARNL3-211ENST00000460176 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 COA4Q9NYJ1 87 aa8.04□□□□□ -1.12
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GARNL3-211ENST00000460176 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 ALG5Q9Y673 324 aa8.04□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.04□□□□□ -1.12
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GARNL3-211ENST00000460176 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 HMX3A6NHT5 357 aa8.03□□□□□ -1.12
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GARNL3-211ENST00000460176 PITX3O75364 302 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 SLC25A6P12236 298 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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GARNL3-211ENST00000460176 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 LFNGQ8NES3 379 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 OR5B3Q8NH48 314 aa8.03□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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GARNL3-211ENST00000460176 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.03□□□□□ -1.12
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GARNL3-211ENST00000460176 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.02□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 APELAP0DMC3 54 aa8.02□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 AREGP15514 252 aa8.02□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP10-3P60369 221 aa8.02□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 PRCDQ00LT1 54 aa8.02□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 WT1-ASQ06250 92 aa8.02□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
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GARNL3-211ENST00000460176 OR52E5Q8NH55 327 aa8.02□□□□□ -1.13
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GARNL3-211ENST00000460176 NXPH3O95157 252 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 IFNA17P01571 189 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV1-40P01703 118 aa8.01□□□□□ -1.13
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GARNL3-211ENST00000460176 CHRNA7P36544 502 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 SPCS3P61009 180 aa8.01□□□□□ -1.13
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GARNL3-211ENST00000460176 SPINK9Q5DT21 86 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 OR5T1Q8NG75 326 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 OR1S1Q8NH92 325 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM68Q96MH6 324 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 GOSR2O14653 212 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 SSNA1O43805 119 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 REG1AP05451 166 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 CTRB1P17538 263 aa8□□□□□ -1.13
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GARNL3-211ENST00000460176 PSMB6P28072 239 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 SLC35B1P78383 322 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 TNFRSF9Q07011 255 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 FOXE3Q13461 319 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 CTRB2Q6GPI1 263 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 C19orf35Q6ZS72 473 aa8□□□□□ -1.13
GARNL3-211ENST00000460176 COMMD1Q8N668 190 aa8□□□□□ -1.13
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