RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 DYNLRB2Q8TF09 96 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 AP3S1Q92572 193 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 ABHD1Q96SE0 405 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 OR51B2Q9Y5P1 312 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 ZNF320A2RRD8 509 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CTDSP2O14595 271 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CLEC3BP05452 202 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CD7P09564 240 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 FOLR2P14207 255 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 PPP5CP53041 499 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 KLK9Q2XQG4 91 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 GDPD1Q8N9F7 314 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 ZNF502Q8TBZ5 544 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 PLEKHA3Q9HB20 300 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 C19orf73Q9NVV2 129 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 KLK9Q9UKQ9 250 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 TMEM213A2RRL7 107 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 RGS5O15539 181 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 SERPINE2P07093 398 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 PGAM2P15259 253 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 CD81P60033 236 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 FAM209BQ5JX69 171 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A24Q6NUK1 477 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 FAAP20Q6NZ36 180 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 SLC38A6Q8IZM9 456 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 MRGPRFQ96AM1 343 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 SEC22AQ96IW7 307 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 STARD9Q9P2P6 4700 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 C15orf61A6NNL5 157 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 ZNF785A8K8V0 405 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 LGALS9O00182 355 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 SNAPC5O75971 98 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 UCP3P55916 312 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 GUCA2BQ16661 112 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 TM4SF20Q53R12 229 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 SPINK9Q5DT21 86 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 GTSCR1Q86UQ5 136 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 LHFPL1Q86WI0 220 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 GPHB5Q86YW7 130 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 CXorf58Q96LI9 332 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 MTFP1Q9UDX5 166 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 MLXQ9UH92 298 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 OR2T8A6NH00 312 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 A8MWP6 167 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 IFNA6P05013 189 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 FGF2P09038 288 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 CBLN1P23435 193 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 S100GP29377 79 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 BTNL8Q6UX41 500 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 DEFB125Q8N687 156 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 UXS1Q8NBZ7 420 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 TP53RKQ96S44 253 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 NEURL2Q9BR09 285 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 ZMAT4Q9H898 229 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 RETNQ9HD89 108 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 TMEM14BQ9NUH8 114 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 PRNDQ9UKY0 176 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 A8MZ25 164 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 TGOLN2O43493 480 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 PIGPP57054 158 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 HAGHQ16775 308 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 FAM106AQ4KMX7 169 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 PLET1Q6UQ28 207 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 TMEM61Q8N0U2 210 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 UBAC2Q8NBM4 344 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 MARCH1Q8TCQ1 289 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 TUBA4BQ9H853 241 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 THYN1Q9P016 225 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 RYR2Q92736 4967 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 F8W735 103 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 K7EIM0 57 aa10.41□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PRAME-209ENST00000439106 RAB3DO95716 219 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms