RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF56Q15929 161 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GV90 55 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 STAG3L3P0CL85 134 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXJ2Q9P0K8 574 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 MSGN1A6NI15 193 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNGR3O43761 229 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 NPIPB7O75200 414 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 NEUROG1Q92886 237 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 NOTCH2Q04721 2471 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PQM1 296 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 J3QW42 95 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM13P0DJ93 91 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 ICAM4Q14773 271 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM160Q9NX00 188 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 TGIF1Q15583 401 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A45Q8N413 288 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 MRAP2Q96G30 205 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM10Q96HG1 83 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 C18orf15Q96N68 181 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 THY1P04216 161 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT11Q96G61 164 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 PRELID3AQ96N28 172 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 MOSP00540 346 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 C14orf144Q96I85 54 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 CHODLQ9H9P2 273 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 SHISA3A0PJX4 238 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMB11A5LHX3 300 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf172C9J069 976 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 UCP1P25874 307 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF26BQ2KJY2 2108 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf128Q5T292 105 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 FADS6Q8N9I5 356 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 JKAMPQ9P055 326 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GUT8 65 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5LO75964 103 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5G2Q06055 141 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMG4Q5JS54 123 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX29Q8N6K0 151 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GWB2 263 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 C4orf51C9J302 202 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 FHL5Q5TD97 284 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 GBF1Q92538 1859 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GV72 72 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 CEACAM4O75871 244 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 EFNB1P98172 346 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 STPG1Q5TH74 334 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 C9JCJ5 164 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 EGR4Q05215 589 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 NIT1Q86X76 327 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 PNKDQ8N490 385 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 SPSB2Q99619 263 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 IL36BQ9NZH7 164 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN2AQ99250 2005 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 M0R381 172 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC17A3O00476 420 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-202ENST00000426333 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms