RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 OR52E5Q8NH55 327 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM131Q92545 1883 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 CLEC3BP05452 202 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 LYZP61626 148 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 LYG1Q8N1E2 194 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 ACACAQ13085 2346 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 M0QZ24 198 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-205ENST00000397611 TIAF1O95411 115 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 ADH4P08319 380 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-205ENST00000397611 SMIM21Q3B7S5 101 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-205ENST00000397611 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-205ENST00000397611 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-205ENST00000397611 OR5P3Q8WZ94 311 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-205ENST00000397611 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-205ENST00000397611 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-205ENST00000397611 OR10AG1Q8NH19 301 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
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PTPRD-205ENST00000397611 ODAMA1E959 279 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 E9PLN8 166 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRD-205ENST00000397611 GPR183P32249 361 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRD-205ENST00000397611 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRD-205ENST00000397611 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 GCHFRP30047 84 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 KIR2DS2P43631 304 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 LRRC29Q8WV35 223 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 C11orf52Q96A22 123 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 UFC1Q9Y3C8 167 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 A0A1B0GWB2 263 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 A0A1W2PRD5 423 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRD-205ENST00000397611 A0A1W2PRF3 423 aa4.58□□□□□ -1.68
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