RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 KIR2DS4P43632 304 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 KIR2DS1Q14954 304 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 RTL8BQ17RB0 113 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 PARM1Q6UWI2 310 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 GJC3Q8NFK1 279 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 K7ERJ3 54 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 COX8AP10176 69 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 DRD3P35462 400 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD1-203ENST00000395211 SPEGQ15772 3267 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TNFSF14O43557 240 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ARL3P36405 182 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 NMUP48645 174 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0J9YY10 115 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 KLK10O43240 276 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 CLPSP04118 112 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 BCL3P20749 454 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 OR52E5Q8NH55 327 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 SPTSSAQ969W0 71 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 C20orf78Q9BR46 151 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 A1L4Q6 167 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 CER1O95813 267 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 MYF5P13349 255 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 PSG5Q15238 335 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 HES3Q5TGS1 186 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 AMTNQ6UX39 209 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 FRG2CA6NGY1 282 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ZIC3O60481 467 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 IL23AQ9NPF7 189 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 LIPT2A6NK58 231 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 SMIM13P0DJ93 91 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 CA6P23280 308 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF585BQ52M93 769 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 H3BMG7 143 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 P04436 131 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 CFHR2P36980 270 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ID1P41134 155 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 CST6Q15828 149 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 C3AR1Q16581 482 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF318Q5VUA4 2279 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 MT-ATP8P03928 68 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 FAM87AP0C7U9 286 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 HHEXQ03014 270 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC29Q8WV35 223 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 SGK494Q96LW2 274 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 OSTCQ9NRP0 149 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 C9JCJ5 164 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TSPAN13O95857 204 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 OR5AL1P0C617 328 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 SYT8Q8NBV8 401 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 NUP35Q8NFH5 326 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00479Q96M42 142 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF488Q96MN9 340 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 VGLL1Q99990 258 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 SPATA25Q9BR10 227 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1B0GWB2 263 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 LIPFP07098 398 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD1-203ENST00000395211 TAS2R45P59539 299 aa7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms