RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCL20P78556 96 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF345Q14585 488 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 CLVS2Q5SYC1 327 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 GLT8D1Q68CQ7 371 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 MED12LQ86YW9 2145 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 DEFB125Q8N687 156 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 C12orf29Q8N999 325 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ODF3Q96PU9 254 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 HDHD2Q9H0R4 259 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 FUT9Q9Y231 359 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 POLEQ07864 2286 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ALPK2Q86TB3 2170 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ROS1P08922 2347 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC16A4O15374 487 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 OCM2P0CE71 109 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 COX5BP10606 129 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 REG1BP48304 166 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAP3K7CLP57077 242 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 DMTNQ08495 405 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 RSU1Q15404 277 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 DEFB115Q30KQ5 88 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 C1orf195Q5TG92 126 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SYPL2Q5VXT5 272 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF439Q8NDP4 499 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPR32P1Q8NGA4 272 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 C11orf40Q8WZ69 217 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 DIRAS2Q96HU8 199 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 GLI3P10071 1580 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 NOTCH1P46531 2555 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 KIF24Q5T7B8 1368 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 A0A1B0GV50 99 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 PMP2P02689 132 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRM2P04554 102 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM228BP0C875 321 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 UCHL3P15374 230 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAGEA2P43356 314 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 RAB5BP61020 215 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 NAA20P61599 178 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRABDQ9H4I3 376 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 IL36BQ9NZH7 164 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SNURFQ9Y675 71 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SETD5Q9C0A6 1442 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 CACNA1BQ00975 2339 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 FABP5P3A8MUU1 101 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 H0Y980 276 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 M0QZ92 97 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 CLPSP04118 112 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SHBGP04278 402 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 STX5Q13190 355 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF846Q147U1 533 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM19A2Q8N3H0 131 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF565Q8N9K5 539 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 RAB8BQ92930 207 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 CNBD2Q96M20 576 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SERPINI1Q99574 410 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 REG4Q9BYZ8 158 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 EFCAB1Q9HAE3 211 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 USE1Q9NZ43 259 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 RP1P56715 2156 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 STRCQ7RTU9 1775 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 PIK3R4Q99570 1358 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 C9orf84Q5VXU9 1444 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 GGT3PA6NGU5 568 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 EVPLLA8MZ36 301 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 C21orf140B9A014 251 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 LRRN3E7EW58 273 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 ACOX3O15254 700 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 DEXIO95424 95 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 OR5G3P0C626 314 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 UBBP0CG47 229 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAP2K4P45985 399 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 BLVRAP53004 296 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 SFXN4Q6P4A7 337 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 RASSF5Q8WWW0 418 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM96AQ9H5X1 160 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 OR5AC2Q9NZP5 309 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-641P-201ENST00000384006 EXPH5Q8NEV8 1989 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAP3K5Q99683 1374 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAST2Q6P0Q8 1798 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 FUOMA2VDF0 154 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 ISG15P05161 165 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 CASQ1P31415 396 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 RUNX1Q01196 453 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-641P-201ENST00000384006 IFITM2Q01629 132 aa0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms