RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-205ENST00000368213 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.97□□□□□ -0.97
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PTPRK-205ENST00000368213 GAS1P54826 345 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-205ENST00000368213 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-205ENST00000368213 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-205ENST00000368213 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-205ENST00000368213 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.97□□□□□ -0.97
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PTPRK-205ENST00000368213 RPRMQ9NS64 109 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 TMEM187Q14656 261 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 COX19Q49B96 90 aa8.94□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 TP53RKQ96S44 253 aa8.94□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 TEX45Q8NA69 505 aa8.94□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 ANK1P16157 1881 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 HERPUD1Q15011 391 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.94□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 ATG101Q9BSB4 218 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF79Q15937 498 aa8.94□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 TEX38Q6PEX7 206 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 DLX1P56177 255 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
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PTPRK-205ENST00000368213 UPK2O00526 184 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 SMUG1Q53HV7 270 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 M0R2Z0 102 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 TRGC1P0CF51 173 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 CD99P14209 185 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-205ENST00000368213 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
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