RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336604.8

IFFO1-201, Transcript of intermediate filament family orphan 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFFO1, Length 2,686 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1-201ENST00000336604 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.65□□□□□ -0.06
IFFO1-201ENST00000336604 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.65□□□□□ -0.06
IFFO1-201ENST00000336604 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.65□□□□□ -0.06
IFFO1-201ENST00000336604 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.65□□□□□ -0.06
IFFO1-201ENST00000336604 PLCE1Q9P212 2302 aa14.65□□□□□ -0.06
IFFO1-201ENST00000336604 OR5I1Q13606 314 aa14.65□□□□□ -0.06
IFFO1-201ENST00000336604 OR4S2Q8NH73 311 aa14.65□□□□□ -0.06
IFFO1-201ENST00000336604 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IFFO1-201ENST00000336604 C15orf61A6NNL5 157 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 OR4A47Q6IF82 309 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 SFRP2Q96HF1 295 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 DSCAMO60469 2012 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 F6UZH7 168 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 M0QZK8 103 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 CXorf1O96002 111 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 LCN2P80188 198 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 LHBP01229 141 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 CGB3P0DN86 165 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 CGB7P0DN87 165 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 CD99P14209 185 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 BRS3P32247 399 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 HINT2Q9BX68 163 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 CEP250Q9BV73 2442 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 ADMP35318 185 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 CDKN1AP38936 164 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 EFNB3Q15768 340 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 Q6ZWC4 215 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 LYG1Q8N1E2 194 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 STPG3Q8N7X2 389 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 IMMP2LQ96T52 175 aa14.63□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.62□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 NPY1RP25929 384 aa14.62□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 FOXH1O75593 365 aa14.62□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TEPPQ6URK8 271 aa14.62□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.62□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.62□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.62□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TNCP24821 2201 aa14.62□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 CA2P00918 260 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 KIR2DS2P43631 304 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 GNG10P50151 68 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 RAB7AP51149 207 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 OCC1Q8TAD7 63 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 FAM122AQ96E09 287 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 ATMQ13315 3056 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TCF21O43680 179 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 GCHFRP30047 84 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 THBS3P49746 956 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 PIP4P1Q86T03 277 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 KALRNO60229 2985 aa14.61□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 GLRXP35754 106 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 FOXL1Q12952 345 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 GAGE1Q13065 139 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 MMP23AO75900 390 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.6□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 ACTL6BO94805 426 aa14.59□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 IGFBP2P18065 325 aa14.59□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 GCM1Q9NP62 436 aa14.59□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 SIAH2O43255 324 aa14.59□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 IGKV1-16P04430 117 aa14.59□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 CBLN1P23435 193 aa14.59□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TIMP3P35625 211 aa14.59□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.59□□□□□ -0.07
IFFO1-201ENST00000336604 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms