RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.97□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 CBLN1P23435 193 aa8.97□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 B9A039 149 aa8.97□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.97□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 FGF5P12034 268 aa8.96□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 REC114Q7Z4M0 266 aa8.96□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 TEX45Q8NA69 505 aa8.96□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.96□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 TDGF1P3P51864 188 aa8.96□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF79Q15937 498 aa8.96□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.95□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 M0QZK8 103 aa8.95□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 TCF19Q9Y242 345 aa8.95□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 CECR9P0C854 216 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 FAM209BQ5JX69 171 aa8.94□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 JMJD8Q96S16 334 aa8.94□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 C4orf51C9J302 202 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A20O43772 301 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 HLA-DRB1P01911 266 aa8.94□□□□□ -0.98
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CLN8-201ENST00000331222 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLN8-201ENST00000331222 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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