RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 OR10C1Q96KK4 312 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 SSX3Q99909 188 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 PLSCR3Q9NRY6 295 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 TCF19Q9Y242 345 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-202ENST00000317118 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.71□□□□□ -1.66
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PDE4D-202ENST00000317118 RRHO14718 337 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 NBR2O15453 112 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 FGF16O43320 207 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 LY86O95711 162 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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PDE4D-202ENST00000317118 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 RAP2BP61225 183 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 RELBQ01201 579 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 RITA1Q96K30 269 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 FKBP11Q9NYL4 201 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 KIAA1456Q9P272 454 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 PRNDQ9UKY0 176 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
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PDE4D-202ENST00000317118 MPTX1A8MV57 137 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 F8WDY8 70 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 M0QZK8 103 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 EREGO14944 169 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 SNAPC5O75971 98 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 BRI3O95415 125 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 ID3Q02535 119 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 GAMTQ14353 236 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 HES1Q14469 280 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 Q6ZRM9 215 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 S100A7AQ86SG5 101 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 MMD2Q8IY49 270 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 OR4A16Q8NH70 328 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM14BQ9NUH8 114 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-202ENST00000317118 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.7□□□□□ -1.66
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PDE4D-202ENST00000317118 PAX6P26367 422 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 F2RL1P55085 397 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 FGL1Q08830 312 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 MMDQ15546 238 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 PRSS8Q16651 343 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 C5orf64Q2M2E5 130 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 PPP1R27Q86WC6 154 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 OR5B3Q8NH48 314 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 SMR3AQ99954 134 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 NEURL2Q9BR09 285 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 PDCD10Q9BUL8 212 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 CACNG5Q9UF02 275 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 H3BUX3 64 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 CLDN34H7C241 214 aa4.69□□□□□ -1.66
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PDE4D-202ENST00000317118 SIX6O95475 246 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 HLA-DRB1P01911 266 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 LYL1P12980 280 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 CNTFRP26992 372 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 TAS2R60P59551 318 aa4.69□□□□□ -1.66
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PDE4D-202ENST00000317118 SSX9Q7RTT3 188 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 Q8N9W7 124 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 VPREB3Q9UKI3 123 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-202ENST00000317118 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.69□□□□□ -1.66
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