RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C18orf12Q96KH6 178 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS8Q16651 343 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FAM89BQ8N5H3 189 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 LRTM2Q8N967 370 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF414Q96IQ9 312 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 LY6G6FQ5SQ64 297 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R60P59551 318 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 OR11H12B2RN74 326 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV3-15P01624 115 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 PDLIM4P50479 330 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 OR11H1Q8NG94 326 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 OR11H2Q8NH07 326 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 SCO2A0A1W2PP80 73 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 SLC17A3O00476 420 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00271P0C7V0 271 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FAM159AQ6UWV7 190 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 WBP1Q96G27 269 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 A1L4Q6 167 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 LEMD1Q68G75 181 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FAM216BQ8N7L0 139 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 KCNS1Q96KK3 526 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 KLK15Q9H2R5 256 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GUT8 65 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GW15 77 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 F8VVB4 439 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 F8VWA3 439 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 ATRAIDQ6UW56 229 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 OR52E5Q8NH55 327 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5G3P48201 142 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 Q6AWC8 147 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA5P20719 270 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 PSMG4Q5JS54 123 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 TEX45Q8NA69 505 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JMM0 328 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPB8 328 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRS3 328 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 KIR3DP1A8MWS1 328 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 RTN4RL2Q86UN3 420 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FMC1Q96HJ9 113 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL15Q9H469 300 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00312Q9Y6C7 94 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R17O96001 155 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 CTAG1AP78358 180 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FAM27E3Q08E93 113 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM144Q7Z5S9 345 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 PRELID3AQ96N28 172 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 SCN2AQ99250 2005 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf172C9J069 976 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5J2P56134 94 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1-2P23083 117 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF56Q15929 161 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 LY6EQ16553 131 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 SBF2Q86WG5 1849 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 TAF1LQ8IZX4 1826 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 UMODP07911 640 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF236Q9UL36 1845 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 PRR32B1ATL7 298 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 YPEL1O60688 119 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 RPL23P62829 140 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 YPEL2Q96QA6 119 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 C21orf62Q9NYP8 219 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 FGF16O43320 207 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 FAM74A4Q5TZK3 123 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GV90 55 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 DCTN5Q9BTE1 182 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 MOB4Q9Y3A3 225 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV24A0A0B4J272 114 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5LO75964 103 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-13P0DP09 117 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 IMMP2LQ96T52 175 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM13P0DJ93 91 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 KLRB1Q12918 225 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 MIR17HGQ75NE6 70 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 H0YIZ8 118 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ID3Q02535 119 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 FAM201AQ5SY85 155 aa17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms