RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 ZP1P60852 638 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 NDUFB4O95168 129 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 EFNB1P98172 346 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 DTX1Q86Y01 620 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 AQP10Q96PS8 301 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 A0A0G2JNJ9 132 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ODAMA1E959 279 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RUNX1Q01196 453 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SGK494Q96LW2 274 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 Q9UFV3 132 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 A0A1B0GW15 77 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ORM2P19652 201 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GATA4P43694 442 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 REG1BP48304 166 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PSG4Q00888 419 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CALYQ9NYX4 217 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 KBTBD11O94819 623 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TWIST1Q15672 202 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 H2BFSP57053 126 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MGAT2Q10469 447 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SPINK9Q5DT21 86 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ASCL4Q6XD76 172 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RMI2Q96E14 147 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RP1P56715 2156 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 DANCRP0C864 163 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 A8MWL6 223 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FFAR1O14842 300 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGKV3-11P04433 115 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HKR1P10072 659 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 JPT1Q9UK76 154 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGKV1D-16P01601 117 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 LINC00869P0C866 280 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CD1BP29016 333 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PRORYQ9H606 182 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PTGDSP41222 190 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PSG9Q00887 426 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PTPRDP23468 1912 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 A0A087WWC5 75 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 NEUROG1Q92886 237 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM101Q96IK0 257 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TYMSP04818 313 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ISG15P05161 165 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TDGF1P13385 188 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MAS1LP35410 378 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM177Q53S58 311 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GAGE2BQ13066 116 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GAGE2EQ4V326 116 aa6.6□□□□□ -1.35
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