RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	CCL11	P51671	97 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	PRRX1	P54821	245 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	FOXL1	Q12952	345 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	PET117	Q6UWS5	81 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	KMT5C	Q86Y97	462 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	SPSB4	Q96A44	273 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	GAGE12B	A1L429	117 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	NPY1R	P25929	384 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	CGA	P01215	116 aa		10.27	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	RAC1	P63000	192 aa		10.27	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	ZNF726P1	Q15940	193 aa		10.27	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.27	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		10.27	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		10.27	□□□□□ -0.76
PXN-222	ENST00000637624	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624		A0A0J9YW62	118 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	LRRC30	A6NM36	301 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	IGLC3	P0DOY3	106 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	GCSH	P23434	173 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	BPIFB3	P59826	476 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624		Q6ZRM9	215 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CELA2A	P08217	269 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	OR1L1	Q8NH94	360 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624		A0A1W2PN81	502 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624		P01737	135 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CT45A6	P0DMU7	189 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CT45A5	P0DMU8	189 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CT45A10	P0DMU9	189 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CT45A7	P0DMV0	189 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	RAC3	P60763	192 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	C7orf71	A4D174	169 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CCL3	P10147	92 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	ORM2	P19652	201 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	COL8A1	P27658	744 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	TMEM45B	Q96B21	275 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	MPDU1	O75352	247 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	PLAU	P00749	431 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CCL1	P22362	96 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CORT	O00230	105 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	ARR3	P36575	388 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	GFRA1	P56159	465 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	SELENOV	P59797	346 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624		E9PLN8	166 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	PIEZO1	Q92508	2521 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CDKN1B	P46527	198 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	PLGLA	Q15195	96 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	MUC21	Q5SSG8	566 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	IGF2R	P11717	2491 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CYB561	P49447	251 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	ARF6	P62330	175 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PXN-222	ENST00000637624	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		10.24	□□□□□ -0.77

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