RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 TPPPO94811 219 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 S1PR2O95136 353 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 NQO2P16083 231 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 MAS1LP35410 378 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
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SGMS1-208ENST00000608287 BET1LQ9NYM9 111 aa14.74□□□□□ -0.05
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SGMS1-208ENST00000608287 OVOL1O14753 267 aa14.73□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 BRI3O95415 125 aa14.73□□□□□ -0.05
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SGMS1-208ENST00000608287 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.72□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.72□□□□□ -0.05
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SGMS1-208ENST00000608287 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.72□□□□□ -0.05
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SGMS1-208ENST00000608287 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.72□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.72□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 COMMD9Q9P000 198 aa14.72□□□□□ -0.05
SGMS1-208ENST00000608287 TEX22C9J3V5 150 aa14.71□□□□□ -0.05
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SGMS1-208ENST00000608287 GABARAPH6UMI1 98 aa14.71□□□□□ -0.05
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SGMS1-208ENST00000608287 TMEM140Q9NV12 185 aa14.71□□□□□ -0.05
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SGMS1-208ENST00000608287 UCP3P55916 312 aa14.7□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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SGMS1-208ENST00000608287 IL18Q14116 193 aa14.7□□□□□ -0.06
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.69□□□□□ -0.06
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SGMS1-208ENST00000608287 AREGP15514 252 aa14.68□□□□□ -0.06
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SGMS1-208ENST00000608287 ATP5G2Q06055 141 aa14.68□□□□□ -0.06
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SGMS1-208ENST00000608287 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.68□□□□□ -0.06
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SGMS1-208ENST00000608287 MCFD2Q8NI22 146 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.68□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 OR2J3O76001 311 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 G6PCP35575 357 aa14.67□□□□□ -0.06
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