RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602591.1

HCG18-246, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

Gene HCG18, Length 1,976 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-246ENST00000602591 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 TIMM23O14925 209 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 NPFFO15130 113 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 SNAPC5O75971 98 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 SERPINE2P07093 398 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 P0C879 139 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 CNTFRP26992 372 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 NMSQ5H8A3 153 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 LGI3Q8N145 548 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 COQ8AQ8NI60 647 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 CFHR4Q92496 578 aa9.52□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 OR2A4O95047 310 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 NXPH3O95157 252 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 IGHV1-69P01742 117 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 HLA-GP17693 338 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 THBS3P49746 956 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 CATR1Q13166 79 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 ZNF695Q8IW36 515 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 RPEQ96AT9 228 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 GPR146Q96CH1 333 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 OR2A7Q96R45 310 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 MAST4O15021 2626 aa9.51□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 A0A0U1RQK1 487 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 RNF212BA8MTL3 300 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 MYOD1P15172 320 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 EPHA1P21709 976 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 S100GP29377 79 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 MOB3BQ86TA1 216 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 STOML3Q8TAV4 291 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 RAB18Q9NP72 206 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 NSG2Q9Y328 171 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 BTBD17A6NE02 478 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 IL15RAQ13261 267 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.5□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 C5orf51A6NDU8 294 aa9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 KCNAB3O43448 404 aa9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 FSHBP01225 129 aa9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 IGLV2-23P01705 113 aa9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 OR9G9P0C7N8 305 aa9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 IL3RAP26951 378 aa9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 RBX1P62877 108 aa9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 TNFRSF9Q07011 255 aa9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 VENTXO95231 258 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 CXCL2P19875 107 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 FHITP49789 147 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 CEBPGP53567 150 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 OPCMLQ14982 345 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 GUCA2BQ16661 112 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 MIDNQ504T8 468 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 ATP6V0BQ99437 205 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 PLEKHA2Q9HB19 425 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 GSKIPQ9P0R6 139 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 C5orf52A6NGY3 159 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 TMEM238C9JI98 176 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 H0YIZ8 118 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 HPRT1P00492 218 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 FOLR2P14207 255 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 VDAC1P21796 283 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 GATA3P23771 443 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 AKR1C2P52895 323 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 LGALS4P56470 323 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 OR2B8PP59922 312 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 OR4S2Q8NH73 311 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 PIFOQ8TCI5 191 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 IL22RA2Q969J5 263 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 CACNG5Q9UF02 275 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 RNF24Q9Y225 148 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.48□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 DLEU1O43261 78 aa9.47□□□□□ -0.89
HCG18-246ENST00000602591 PITX3O75364 302 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms